17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0602 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  1012    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  36.95 
 
 		 681 aa  224  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  32.03 
 
 		 825 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  33.42 
 
 		 846 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  33.01 
 
 		 751 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  28.07 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  25.73 
 
 		 689 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  25.46 
 
 		 724 aa  87  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0325  hypothetical protein  36.54 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.606726  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  24.66 
 
 		 833 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  25.49 
 
 		 920 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  22.68 
 
 		 756 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1907  hypothetical protein  34.62 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.27137  hitchhiker  0.000000104796 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0468  hypothetical protein  26.67 
 
 		 566 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  21.69 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  24.35 
 
 		 820 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5170  hypothetical protein  24.4 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196201  normal  0.530069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>