42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1502 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1502  YHS domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000768373 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0591  hypothetical protein  65.96 
 
 
148 aa  191  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0413  hypothetical protein  57.55 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.940702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0344  YHS domain-containing protein  54.41 
 
 
159 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3004  YHS domain-containing protein  55.32 
 
 
152 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3420  hypothetical protein  45.45 
 
 
168 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0574183  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2511  YHS domain protein  47.95 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0278163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2766  hypothetical protein  43.15 
 
 
150 aa  124  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.395057  hitchhiker  0.00432931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2573  hypothetical protein  48.25 
 
 
151 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.243278  hitchhiker  0.000000387567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2489  hypothetical protein  42.18 
 
 
174 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3397  hypothetical protein  43.18 
 
 
161 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0295  YHS domain-containing protein  47.41 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1871  hypothetical protein  46.96 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0814  hypothetical protein  44.25 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3840  hypothetical protein  41.67 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000166878  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3074  hypothetical protein  39.86 
 
 
161 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.479562  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1024  hypothetical protein  35.25 
 
 
181 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.476818  normal  0.586442 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01845  hypothetical protein  47.37 
 
 
150 aa  104  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3054  YHS domain-containing protein  40.91 
 
 
149 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.190417  hitchhiker  0.00884153 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1237  hypothetical protein  42.11 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1237  hypothetical protein  42.11 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2513  hypothetical protein  41.59 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0288069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1901  YHS  34.27 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2051  hypothetical protein  32.64 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2799  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  36.23 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0517  hypothetical protein  27.41 
 
 
168 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1716  hypothetical protein  41.28 
 
 
211 aa  83.6  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302746 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0661  hypothetical protein  36.88 
 
 
190 aa  82  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313662  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3681  hypothetical protein  31.21 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2517  YHS domain protein  37.61 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  0.0264071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6562  hypothetical protein  31.71 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3825  hypothetical protein  31.82 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4250  hypothetical protein  30.83 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531589  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3379  hypothetical protein  28.91 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1814  hypothetical protein  31.01 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4039  hypothetical protein  33.04 
 
 
194 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285921  normal  0.0353686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1729  YHS  29.58 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3923  hypothetical protein  29.84 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000190971  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0281  YHS domain protein  36.72 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1688  hypothetical protein  35.96 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0271736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4842  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203705  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2082  hypothetical protein  29.91 
 
 
932 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.602266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>