58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0862 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  819    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  66.33 
 
 
393 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  59.07 
 
 
394 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  58.72 
 
 
390 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  58.46 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  59.95 
 
 
399 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  60.69 
 
 
405 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.04 
 
 
395 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  60.69 
 
 
413 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  60.79 
 
 
405 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  59.26 
 
 
386 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  58.42 
 
 
378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  58.07 
 
 
394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.85 
 
 
386 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  55.36 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  58.36 
 
 
378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  55.73 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  55.5 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  55.5 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  59.02 
 
 
392 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  55.5 
 
 
380 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  56.99 
 
 
388 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  54.85 
 
 
396 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  55.93 
 
 
392 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  55.93 
 
 
392 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  55.93 
 
 
393 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  57.22 
 
 
394 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  55.3 
 
 
394 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  54.06 
 
 
391 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.3 
 
 
394 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  56.78 
 
 
400 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  55.32 
 
 
395 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  56.6 
 
 
389 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  53.69 
 
 
397 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  53.49 
 
 
414 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  53.61 
 
 
383 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  51.69 
 
 
400 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  67.73 
 
 
228 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  58.9 
 
 
242 aa  303  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.21 
 
 
291 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  28.03 
 
 
277 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.64 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.26 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.16 
 
 
288 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.94 
 
 
278 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.73 
 
 
281 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.62 
 
 
293 aa  90.5  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.61 
 
 
294 aa  89.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.64 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.96 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.15 
 
 
299 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.32 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2542  hypothetical protein  26.34 
 
 
308 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0886  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  26.62 
 
 
300 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1581  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.69 
 
 
273 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4894  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  32.67 
 
 
257 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0204  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  27.97 
 
 
293 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1969  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  27.04 
 
 
262 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>