22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3396 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  99.67 
 
 
438 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  49.34 
 
 
503 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  43.54 
 
 
701 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  43.54 
 
 
701 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  43.54 
 
 
701 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  46.18 
 
 
429 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  42.48 
 
 
692 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1576  hypothetical protein  40.71 
 
 
676 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.592889  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  40.79 
 
 
606 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  36.72 
 
 
676 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  36.72 
 
 
680 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  36.72 
 
 
676 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  41.37 
 
 
357 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  35.39 
 
 
328 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  33.55 
 
 
502 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  32.38 
 
 
386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  32.75 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2970  hypothetical protein  29.29 
 
 
370 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.751767  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1433  hypothetical protein  25.68 
 
 
350 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5522  hypothetical protein  23.55 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.853914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>