61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0107 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0107  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  492  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  23.91 
 
 
276 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
257 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
271 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3758  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102205  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
283 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
394 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
308 aa  58.5  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  21.4 
 
 
301 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
371 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  23.68 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  23 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
305 aa  55.1  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
282 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
374 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  22.81 
 
 
314 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
310 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
378 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
336 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  22.82 
 
 
412 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
459 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
308 aa  48.9  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 
414 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 
242 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  22.35 
 
 
319 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  22.58 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
308 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0422  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.81 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
394 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0306  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  22.5 
 
 
315 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
299 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.18 
 
 
246 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  21.03 
 
 
324 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
559 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  25.51 
 
 
334 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  24.71 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1563  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0886  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  22.57 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
480 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0724  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0259046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0710  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.96 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0704  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  23.89 
 
 
406 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.96 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.96 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 
230 aa  42.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
313 aa  42.4  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  21.1 
 
 
309 aa  42.4  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  22.31 
 
 
382 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.88 
 
 
264 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.51 
 
 
247 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>