22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1748 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 130 aa  267  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  97.69 
 
 		 130 aa  264  4e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  96.92 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  73.08 
 
 		 130 aa  206  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  56.15 
 
 		 130 aa  159  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  32.08 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  31.73 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  39 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1080  hypothetical protein  29.52 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1140  hypothetical protein  27.78 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  18.42 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  23.58 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 153 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0847  transcriptional regulator, TrmB  19.61 
 
 		 205 aa  40  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>