24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1642 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1642  type II secretion system protein  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.226081  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0911  type II secretion system protein  94.3 
 
 		 298 aa  564  1e-160  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1035  type II secretion system protein  95.97 
 
 		 298 aa  557  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.124398 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1035  type II secretion system protein  79.53 
 
 		 298 aa  496  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1152  type II secretion system protein  57.53 
 
 		 295 aa  348  9e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1041  hypothetical protein  74.58 
 
 		 198 aa  276  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1047  hypothetical protein  74.58 
 
 		 198 aa  276  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1053  hypothetical protein  74.58 
 
 		 198 aa  276  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.380793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  25.63 
 
 		 660 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  25.83 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  25.55 
 
 		 326 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  27.48 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  24.43 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  24.44 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  26.99 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  25 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  21.9 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  21.89 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  22.45 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>