27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0280 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0280  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  579  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0146684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2174  hypothetical protein  34.93 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0803521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1537  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.376192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0110  response regulator receiver  36.27 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2442  response regulator receiver protein  35.23 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0259595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0241  response regulator receiver protein  35.41 
 
 		 309 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0195  response regulator receiver domain-containing protein  36.32 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4510  response regulator receiver domain-containing protein  31.61 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.078722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2440  response regulator receiver protein  34.64 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0208  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0102  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  29.2 
 
 		 568 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1112  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 		 160 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2329  response regulator receiver  29.92 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 564 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2151  hypothetical protein  30.83 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3703  response regulator receiver  32.14 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 574 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2761  response regulator receiver  30.12 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  28.66 
 
 		 571 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  28.66 
 
 		 571 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  23.08 
 
 		 577 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  23.03 
 
 		 577 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  22.86 
 
 		 565 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  30.43 
 
 		 141 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  27.66 
 
 		 575 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>