91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0056 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0034  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.903011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna1  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0002  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0077  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0044  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0044  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0035  tRNA-Met  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt17  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt17  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0102  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000510016  normal  0.102262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0006  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2045  tRNA-Met  85.33 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0329  tRNA-Met  92.86 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000153412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0027  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155792  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0031  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.240758  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0062  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000650555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0066  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00279413  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0031  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000375201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0035  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000293929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0332  tRNA-Met  92.86 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0061  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0065  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0370622  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0074  tRNA-Met  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0032  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000831848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0028  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000167131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4255  tRNA-Met  92.86 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.1357e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4259  tRNA-Met  92.86 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0023  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.013256 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0019  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.854123  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0019  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0106  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000245591  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0096  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000771704  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0100  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000240677  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0091  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.62007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0040  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000012917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0041  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0156  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t108  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118343  hitchhiker  0.00000000052642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0159  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000201379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0125  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000214753  hitchhiker  0.00047099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0129  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000830942  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01240  tRNA-Met  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0052  tRNA-Met  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.058148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna147  tRNA-Met  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna143  tRNA-Met  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000903927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna135  tRNA-Met  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000774984  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna132  tRNA-Met  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t013  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114065  hitchhiker  0.000000000483497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0048  tRNA-Met  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000017739  normal  0.0157813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t018  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0030  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000378723  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0032  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000017089  normal  0.142093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0036  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524362  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0033  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000181749  normal  0.113479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0037  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000667787  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0038  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000161182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0031  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000967357  normal  0.0254093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0035  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000026454  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0052  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.526652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0108  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000925479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0112  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000385548  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0153  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000229594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0101  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000109758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0105  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000402123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0044  tRNA-Met  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000282394  normal  0.033686 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01243  tRNA-Met  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t014  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0116  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01238  tRNA-Met  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0034  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0120  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0034  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000193112  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0026  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000983992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0041  tRNA-Met  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna124  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0012  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0010  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0059  tRNA-Phe  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00036948  normal  0.453109 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0022  tRNA-Phe  86.44 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0039  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0032  tRNA-Met  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169141  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0005  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125114  hitchhiker  0.00000268461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0027  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0579561  normal  0.867818 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0050  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180994 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0013  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0131677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>