13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0153 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0153  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  903    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1527  hypothetical protein  46.8 
 
 
494 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0633  hypothetical protein  44.12 
 
 
482 aa  286  7e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  25.11 
 
 
602 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  25.07 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  25.31 
 
 
425 aa  66.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2011  hypothetical protein  24.9 
 
 
490 aa  63.9  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  23.49 
 
 
570 aa  57  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  26.67 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  26.67 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  24.06 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  21.85 
 
 
441 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  25.25 
 
 
475 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>