182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0015 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0015  5S ribosomal RNA  100 
 
 
122 bp  242  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.299656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0030  5S ribosomal RNA  100 
 
 
122 bp  242  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0058  5S ribosomal RNA  100 
 
 
122 bp  242  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000016454 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0039  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 
121 bp  63.9  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 
114 bp  58  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 
110 bp  58  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
123 bp  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
115 bp  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0002  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
111 bp  50.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0907588  normal  0.790513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
115 bp  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0003  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
111 bp  50.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.641144 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0001  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
111 bp  50.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.959886  normal  0.621244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
115 bp  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
115 bp  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
116 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0013  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  48.1  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0042  5S ribosomal RNA  100 
 
 
120 bp  48.1  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0023  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 
116 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.881601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0042  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 
116 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.1617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0047  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 
116 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0065  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 
116 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0048  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 
118 bp  46.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5743  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5746  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5752  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5755  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5761  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5764  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  86 
 
 
111 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5773  5S ribosomal RNA  86 
 
 
119 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000449498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-1  5S ribosomal RNA  86 
 
 
119 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-2  5S ribosomal RNA  86 
 
 
119 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-3  5S ribosomal RNA  86 
 
 
119 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-4  5S ribosomal RNA  86 
 
 
119 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000434423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-6  5S ribosomal RNA  86 
 
 
119 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-7  5S ribosomal RNA  86 
 
 
119 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-8  5S ribosomal RNA  86 
 
 
119 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-9  5S ribosomal RNA  86 
 
 
119 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000019949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  86 
 
 
114 bp  44.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.069713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  86 
 
 
114 bp  44.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  86 
 
 
114 bp  44.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  86 
 
 
114 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000269738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  86 
 
 
118 bp  44.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SA  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SB  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SH  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0012  5S ribosomal RNA  86 
 
 
115 bp  44.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0017  5S ribosomal RNA  86 
 
 
115 bp  44.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000279658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0032  5S ribosomal RNA  86 
 
 
115 bp  44.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000010425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0056  5S ribosomal RNA  86 
 
 
115 bp  44.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0061  5S ribosomal RNA  86 
 
 
115 bp  44.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0064  5S ribosomal RNA  86 
 
 
115 bp  44.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0073  5S ribosomal RNA  86 
 
 
115 bp  44.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000636954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0092  5S ribosomal RNA  86 
 
 
115 bp  44.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000371886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0140  5S ribosomal RNA  86 
 
 
115 bp  44.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0005  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0012  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0029  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0032  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0299918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0056  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000667986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0061  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0064  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0067  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0070  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0073  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0076  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0144  5S ribosomal RNA  86 
 
 
116 bp  44.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000122827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>