28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1566 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1566  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  400  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.675454  hitchhiker  0.00439427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0545  hypothetical protein  62.83 
 
 
191 aa  257  6e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0274885  normal  0.338347 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1876  hypothetical protein  62.3 
 
 
191 aa  238  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1963  hypothetical protein  58.64 
 
 
189 aa  235  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3024  hypothetical protein  49.74 
 
 
194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0907  hypothetical protein  52.26 
 
 
202 aa  184  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3229  hypothetical protein  46.57 
 
 
211 aa  158  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000502715  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0609  hypothetical protein  43.75 
 
 
196 aa  156  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1447  hypothetical protein  39.05 
 
 
199 aa  140  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353847  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1107  hypothetical protein  41.18 
 
 
198 aa  137  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0918  protein of unknown function DUF358  40.2 
 
 
189 aa  129  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000434231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0735  protein of unknown function DUF358  36.71 
 
 
199 aa  127  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0171  hypothetical protein  38.5 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.190358  normal  0.933799 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0217  hypothetical protein  35.5 
 
 
198 aa  124  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.638507  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0669  hypothetical protein  35.29 
 
 
204 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.239778  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1731  hypothetical protein  36.5 
 
 
198 aa  111  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2697  protein of unknown function DUF358  35.96 
 
 
199 aa  111  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0731  hypothetical protein  37 
 
 
198 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.336545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1588  hypothetical protein  34.25 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00408937 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000860  hypothetical protein  27.86 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000138514  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0182  hypothetical protein  27.5 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06835  hypothetical protein  26.87 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1778  hypothetical protein  24.16 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.459954  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2539  hypothetical protein  23.73 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1812  hypothetical protein  23.73 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00771142  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2654  hypothetical protein  23.73 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2532  hypothetical protein  23.73 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0460  hypothetical protein  25 
 
 
177 aa  41.2  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>