More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1260 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  100 
 
 
461 aa  963    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  64.14 
 
 
442 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  62.05 
 
 
442 aa  599  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  61.59 
 
 
442 aa  589  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  58.45 
 
 
443 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  56.29 
 
 
441 aa  547  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  56.62 
 
 
444 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  55.38 
 
 
444 aa  522  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  56.19 
 
 
444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  54.04 
 
 
442 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  55.05 
 
 
444 aa  512  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  55.05 
 
 
444 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  55.02 
 
 
445 aa  513  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  54.36 
 
 
444 aa  508  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  55.3 
 
 
444 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  54.36 
 
 
444 aa  508  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  56.38 
 
 
433 aa  509  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  54.13 
 
 
444 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  54.36 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  54.36 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  54.36 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  54.36 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  54.36 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  54.13 
 
 
444 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  54.46 
 
 
444 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  53.79 
 
 
443 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  54.92 
 
 
445 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  54 
 
 
442 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  52.31 
 
 
447 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  54.73 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  54.67 
 
 
446 aa  488  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  52.6 
 
 
449 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  52.51 
 
 
446 aa  487  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  52.7 
 
 
444 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  53 
 
 
443 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  53.79 
 
 
443 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  52.52 
 
 
446 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  50.34 
 
 
442 aa  482  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  52.52 
 
 
446 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  53.78 
 
 
445 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  51.49 
 
 
440 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  52.31 
 
 
443 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  51.26 
 
 
439 aa  475  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  52.98 
 
 
452 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  53.07 
 
 
439 aa  474  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  53.16 
 
 
443 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  50.57 
 
 
442 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  50.46 
 
 
441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  51.03 
 
 
439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  50.34 
 
 
448 aa  462  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  51.61 
 
 
437 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  50.34 
 
 
447 aa  463  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  53.18 
 
 
451 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  52.62 
 
 
446 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  52.41 
 
 
444 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  49.21 
 
 
443 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  48.98 
 
 
443 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  50.58 
 
 
439 aa  457  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  48.3 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  49.31 
 
 
446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  51 
 
 
456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  50.68 
 
 
447 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  52.35 
 
 
450 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  47.63 
 
 
456 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  49.2 
 
 
448 aa  449  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  50.46 
 
 
448 aa  450  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  52.61 
 
 
451 aa  451  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  51.15 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  48.62 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  48.64 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  51.38 
 
 
447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  50.91 
 
 
449 aa  442  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  51.71 
 
 
451 aa  444  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  48.42 
 
 
446 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  49.21 
 
 
450 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  48.51 
 
 
445 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  50.69 
 
 
447 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  48.62 
 
 
448 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  47.74 
 
 
446 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  49.21 
 
 
452 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  48.21 
 
 
453 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  48.51 
 
 
443 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 
444 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  47.4 
 
 
448 aa  426  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  47.85 
 
 
447 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  47.14 
 
 
446 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  48.05 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  45.64 
 
 
448 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  44.8 
 
 
446 aa  411  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  46.28 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  47.49 
 
 
445 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  46.28 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  46.05 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  45.82 
 
 
444 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  43.97 
 
 
453 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  44.92 
 
 
444 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  46.83 
 
 
444 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  46.7 
 
 
446 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  46.22 
 
 
447 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  46.7 
 
 
446 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>