15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1179 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1179  geranylgeranylglyceryl phosphate synthase family protein  100 
 
 
506 aa  1041    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.6021  normal  0.228569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2486  metallophosphoesterase  43.89 
 
 
586 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.907019  normal  0.296957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1468  metallophosphoesterase  44.76 
 
 
804 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5249  metallophosphoesterase  42.15 
 
 
659 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0905  twin-arginine translocation pathway signal  42.77 
 
 
662 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.486466  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0794  twin-arginine translocation pathway signal  40.47 
 
 
659 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2027  metallophosphoesterase  39.51 
 
 
595 aa  349  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2905  metallophosphoesterase  42.77 
 
 
593 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2026  metallophosphoesterase  41.26 
 
 
719 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3235  metallophosphoesterase  28.54 
 
 
499 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2843  metallophosphoesterase  23.76 
 
 
527 aa  133  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00214985  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4124  metallophosphoesterase  26.53 
 
 
554 aa  128  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1384  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
546 aa  82.8  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
369 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.06 
 
 
274 aa  43.9  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>