25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0402 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  712    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  33.92 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  31.85 
 
 
368 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  30.45 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  31.85 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  30.4 
 
 
449 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  35.5 
 
 
340 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  33.51 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  32.26 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  31.01 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  29.14 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  27.85 
 
 
452 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  25.48 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  26.14 
 
 
445 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  23.74 
 
 
363 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  40.7 
 
 
450 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  27.68 
 
 
390 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  32.17 
 
 
415 aa  59.7  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  34.86 
 
 
453 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  27.45 
 
 
580 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  27.89 
 
 
521 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  30.09 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  36.47 
 
 
414 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  33.64 
 
 
421 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01835  hypothetical protein  22.03 
 
 
344 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0670958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>