54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1884 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1837  YCII-related  100 
 
 		 111 aa  226  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1818  YCII-related protein  100 
 
 		 111 aa  226  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1884  YCII-related  100 
 
 		 111 aa  226  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.536807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  37.97 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  33.33 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  32.5 
 
 		 96 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  31.65 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  31.65 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  31.65 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  32.56 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  30.86 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  27.78 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  34.07 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  32.22 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  33.71 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  30.68 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  27.78 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  26.61 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  33.33 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  27.78 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  27.78 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  27.78 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  27.78 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  27.78 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  27.78 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  27.78 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  28.89 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  24.64 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2720  hypothetical protein  30.43 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  42.62 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  26.32 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  31.25 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  30.77 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  35.56 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  40.98 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  42.62 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  22.78 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  27.85 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  27.16 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  30.53 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  28.41 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  23.75 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  24 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  29.73 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  34.15 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  36.59 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  28.41 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3299  YCII-related protein  36 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  30.43 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  25.26 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  25.26 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  27.27 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  35 
 
 		 98 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  35.71 
 
 		 96 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>