26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2930 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  777    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  43.77 
 
 
380 aa  311  9e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  39.54 
 
 
379 aa  259  6e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  38.25 
 
 
430 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  37 
 
 
483 aa  226  6e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  37.58 
 
 
415 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  36.42 
 
 
455 aa  209  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  36.76 
 
 
459 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  31.94 
 
 
422 aa  194  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0061  hypothetical protein  34.86 
 
 
386 aa  192  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0195  hypothetical protein  33.14 
 
 
391 aa  162  9e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000146938  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  48.04 
 
 
328 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0757  hypothetical protein  26.84 
 
 
459 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.503985  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  28.3 
 
 
463 aa  157  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  24.32 
 
 
405 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  27.17 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  22.88 
 
 
431 aa  63.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  31.97 
 
 
505 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  23.75 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  24.55 
 
 
418 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  25.35 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  29.6 
 
 
425 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  27.67 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1517  hypothetical protein  27.85 
 
 
498 aa  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  20 
 
 
411 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  23.22 
 
 
415 aa  42.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>