35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1615 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  289  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  52.98 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0501  hypothetical protein  52.45 
 
 
152 aa  131  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  42.25 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  37.09 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  26.21 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  25.52 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  29.25 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  28.87 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  28.17 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  27.63 
 
 
149 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  30.56 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  26.76 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  27.81 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0770  hypothetical protein  28.46 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  27.89 
 
 
464 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0358  hypothetical protein  28.93 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  29.86 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  27.21 
 
 
462 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  27.21 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  29.58 
 
 
510 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  28.15 
 
 
470 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  30.23 
 
 
455 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  24 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  31.45 
 
 
473 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2991  protein of unknown function DUF107  31.72 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  26.76 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  26.53 
 
 
460 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  24.16 
 
 
459 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  27.63 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  27.52 
 
 
481 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  24.64 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  26.87 
 
 
501 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  26.87 
 
 
501 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>