35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0501 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0501  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  283  8e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  53.33 
 
 
151 aa  159  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  57.14 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  49.66 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  44.9 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  28.38 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  26.76 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  27.7 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  30.14 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.08 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  26.9 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  28.03 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  31.51 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  28.37 
 
 
140 aa  47.4  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  30.22 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  28.78 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  29.17 
 
 
460 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  27.7 
 
 
443 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  27.92 
 
 
462 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  35.48 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  31.94 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  31.19 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  28.06 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  35.9 
 
 
125 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  28.06 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  31.72 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  26.57 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  25.56 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  34.09 
 
 
425 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  27.92 
 
 
152 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  27.21 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2991  protein of unknown function DUF107  35.76 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  26.67 
 
 
473 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  28.93 
 
 
496 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0358  hypothetical protein  25.41 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>