62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3331 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  78.62 
 
 		 563 aa  879    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 565 aa  1139    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  78.62 
 
 		 563 aa  879    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  86.2 
 
 		 559 aa  952    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  78.62 
 
 		 563 aa  879    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.31 
 
 		 584 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.71 
 
 		 559 aa  587  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  49.91 
 
 		 580 aa  569  1e-161  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  48.9 
 
 		 594 aa  541  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.291051 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  45.5 
 
 		 576 aa  525  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 		 600 aa  501  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  49.26 
 
 		 574 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  49.26 
 
 		 559 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  49.26 
 
 		 601 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  47.96 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  47.96 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  47.96 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  47.96 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  37.79 
 
 		 563 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 		 571 aa  297  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.54 
 
 		 572 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.36 
 
 		 572 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  32.9 
 
 		 560 aa  293  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  36.65 
 
 		 568 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 580 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  34.97 
 
 		 626 aa  278  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  36.64 
 
 		 539 aa  278  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  34.85 
 
 		 587 aa  277  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  34.93 
 
 		 568 aa  276  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 525 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  33.21 
 
 		 621 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  33.65 
 
 		 578 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 601 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.95 
 
 		 625 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 533 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 		 625 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 598 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 625 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 623 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  29.17 
 
 		 577 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 563 aa  193  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 506 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  26.55 
 
 		 530 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  26.56 
 
 		 530 aa  100  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 541 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  26.26 
 
 		 556 aa  83.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.88 
 
 		 871 aa  71.2  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 532 aa  57  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 205 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 3172 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 602 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 543 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 699 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1192 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 927 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1138 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 750 aa  44.3  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 743 aa  44.3  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.42 
 
 		 265 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  28.38 
 
 		 573 aa  43.5  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>