41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3320 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3320  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
160 aa  334  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0893741  normal  0.0464114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3041  carboxymuconolactone decarboxylase  91.25 
 
 
160 aa  310  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0701219  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2755  carboxymuconolactone decarboxylase  71.34 
 
 
164 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2785  carboxymuconolactone decarboxylase  71.34 
 
 
164 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2799  carboxymuconolactone decarboxylase  71.34 
 
 
164 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588172  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3310  hypothetical protein  40.85 
 
 
184 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0070773  hitchhiker  0.0000283034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4386  hypothetical protein  36.08 
 
 
185 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.545671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  36.69 
 
 
170 aa  97.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3715  hypothetical protein  39.16 
 
 
188 aa  97.8  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000983453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  36.53 
 
 
185 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.81 
 
 
159 aa  84.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2657  hypothetical protein  29.05 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0598  putative carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 
169 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17953  normal  0.124387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.57 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1900  carboxymuconolactone decarboxylase  28.35 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.429889  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.42 
 
 
143 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.55 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.06 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.13 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  25 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.88 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  28.3 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  26.15 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4459  hypothetical protein  27.52 
 
 
210 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2738  alkylhydroperoxidase  26.53 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0546441  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  26.27 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  24.56 
 
 
167 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  27.36 
 
 
145 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.19 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0891  carboxymuconolactone decarboxylase  25.37 
 
 
218 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.911286  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.84 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.42 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  26.42 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  22.76 
 
 
153 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.72 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1381  hypothetical protein  24.78 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0666475  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  24.22 
 
 
159 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  24.22 
 
 
159 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1279  hypothetical protein  24.78 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.966025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.01 
 
 
163 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>