20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3217 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3217  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 282 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0753404  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.79 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.68 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4527  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.53 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.82 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.11 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.88 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.49 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1538  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.3 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2079  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.09 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1480  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.01 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113163  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12892  integral membrane protein  31.47 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.23 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.2 
 
 		 672 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.9 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.9 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.9 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.5 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  23.61 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.81 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>