51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2177 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2177  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148812  normal  0.0743485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4520  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  76.19 
 
 		 190 aa  263  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0352  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  57.76 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0342  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  57.76 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0331  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  55.09 
 
 		 206 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2611  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.06 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.132011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0106  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  54.1 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0104  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.39 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26850  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  50.81 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.405147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6027  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.67 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.350512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1418  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.1 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5359  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.75 
 
 		 175 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2708  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.22 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.826826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1423  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.21 
 
 		 237 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2514  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.86 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2545  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.18 
 
 		 137 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07970  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  43.88 
 
 		 291 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131897  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2293  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.84 
 
 		 303 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2154  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.01 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119345  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.38 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.38 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3005  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.21 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.21 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.81 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.21 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0633  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  30.3 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0292  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  25.71 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.07 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.07 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.07 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.07 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.07 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  31.36 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.07 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.85 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.41 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1388  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.41 
 
 		 291 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.423501  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  34 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0595  putative carboxypeptidase  25.21 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1065  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  25.19 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.95 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2914  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  29.9 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  28.15 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.29 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.48 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1899  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  25.32 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  28.74 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.81 
 
 		 368 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2266  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.23 
 
 		 243 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0349976  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  36 
 
 		 248 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.127155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>