29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2547 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2547  metallophosphoesterase  100 
 
 
306 aa  616  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2770  metallophosphoesterase  98.01 
 
 
301 aa  595  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2477  metallophosphoesterase  85.38 
 
 
301 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0215204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1478  twin-arginine translocation pathway signal  56.05 
 
 
314 aa  345  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0847  metallophosphoesterase  55.88 
 
 
281 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0967  metallophosphoesterase  54.95 
 
 
281 aa  318  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1238  hypothetical protein  43.8 
 
 
286 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0024  hypothetical protein  33.06 
 
 
276 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000144277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0208  metallophosphoesterase  23.93 
 
 
270 aa  102  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2381  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
276 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2032  hypothetical protein  29.96 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136502  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2785  metallophosphoesterase  26.1 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2539  hypothetical protein  27.8 
 
 
280 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9280  predicted protein  27.61 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0237  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
267 aa  85.9  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00113415  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1563  metallophosphoesterase  25.77 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5767  predicted protein  27.02 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5807  predicted protein  26.92 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.731191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1080  metallophosphoesterase  26.74 
 
 
659 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0645361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  24.27 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  29.79 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  33.33 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  26.03 
 
 
680 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4466  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  23.97 
 
 
820 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4124  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
554 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2499  hypothetical protein  28.86 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3471  metallophosphoesterase  27.72 
 
 
607 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0906  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  23.68 
 
 
819 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0726  metallophosphoesterase  23.68 
 
 
820 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.972215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>