25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0457 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  270  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  89.13 
 
 		 138 aa  190  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  71.9 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  71.07 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  71.07 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  77.7 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  60 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  71.2 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  51.8 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  51.8 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  66.4 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  69.57 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  53.96 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  52.52 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  49.64 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  58.99 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  52.52 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  51.8 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  46.85 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  42.16 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  33.81 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  41.25 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  37.84 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  41.18 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  39.71 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>