15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1274 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1274  RNA polymerase dimerisation  100 
 
 		 95 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.943087  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1412  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  75 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1264  RNA polymerase dimerisation  75 
 
 		 96 aa  144  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.818462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0692  RNA polymerase dimerisation  72.92 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202688  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0190  RNA polymerase dimerisation  65.96 
 
 		 95 aa  117  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.388053  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  35.29 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0627  RNA polymerase dimerisation  34.85 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0004  RNA polymerase, dimerisation  32.97 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.627074  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1961  RNA polymerase dimerisation  33.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3577  RNA polymerase dimerization  34.15 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30435  predicted protein  27.38 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  34.12 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1862  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  30.11 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0620  RNA polymerase dimerisation  30.12 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00678824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1793  RNA polymerase dimerization  31.34 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>