56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4380 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  76.82 
 
 		 386 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  78.64 
 
 		 378 aa  350  8.999999999999999e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  75.45 
 
 		 386 aa  348  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  70.91 
 
 		 405 aa  324  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  70.91 
 
 		 413 aa  324  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  70.45 
 
 		 405 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  71.04 
 
 		 394 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  71.04 
 
 		 394 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  71.82 
 
 		 390 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  70.59 
 
 		 395 aa  317  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  71.04 
 
 		 393 aa  317  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  70.59 
 
 		 394 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  70.14 
 
 		 394 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  70.59 
 
 		 392 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  70.59 
 
 		 392 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  67.73 
 
 		 400 aa  314  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  69.68 
 
 		 394 aa  314  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  69.23 
 
 		 396 aa  314  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  67.73 
 
 		 391 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  69.09 
 
 		 393 aa  310  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.18 
 
 		 395 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  70.45 
 
 		 399 aa  308  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  65.45 
 
 		 389 aa  305  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  67.73 
 
 		 392 aa  305  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  64.55 
 
 		 392 aa  301  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  68.64 
 
 		 399 aa  298  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  65 
 
 		 400 aa  297  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  66.36 
 
 		 388 aa  295  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  66.05 
 
 		 400 aa  294  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  66.36 
 
 		 397 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  66.82 
 
 		 394 aa  292  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  64.09 
 
 		 380 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  64.09 
 
 		 380 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  64.09 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  63.64 
 
 		 383 aa  280  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  61.01 
 
 		 414 aa  271  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  61.54 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.7 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.11 
 
 		 281 aa  95.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.13 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  34.24 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.61 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.24 
 
 		 290 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.38 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.65 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.73 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.33 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.89 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.32 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.86 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0616  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  27.5 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3036  fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2  27.08 
 
 		 314 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2814  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.98 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0288825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0204  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  25.71 
 
 		 293 aa  41.6  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>