19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0057 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0057  outer membrane protease  100 
 
 
320 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.581997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1618  outer membrane protease  36.02 
 
 
238 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.918061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1643  outer membrane protease  28.01 
 
 
373 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0009  outer membrane protease  28.4 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0023  outer membrane protease  28.4 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2452  outer membrane protease  30.52 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2311  outer membrane protease  28.76 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2624  outer membrane protease  27.79 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1900  outer membrane protease  28.62 
 
 
312 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.999747  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3064  Plasminogen activator Pla  26.97 
 
 
317 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00663458  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2753  outer membrane protease  28.07 
 
 
312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.78481  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2535  outer membrane protease  28.07 
 
 
312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2584  outer membrane protease  27.19 
 
 
312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2648  outer membrane protease  27.19 
 
 
312 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1653  outer membrane protease  26.97 
 
 
317 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00332397  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0099  outer membrane protease  24.76 
 
 
317 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0161825  hitchhiker  0.00000610402 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1453  outer membrane protease  24.39 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.424492  normal  0.752395 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0311  outer membrane protease  24.76 
 
 
326 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2831  outer membrane protease  25.38 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>