14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2800 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0750  hypothetical protein  50.65 
 
 
1861 aa  1650    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2800  protein of unknown function DUF11  100 
 
 
1861 aa  3650    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.515437  normal  0.451772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0311  hypothetical protein  33.74 
 
 
1063 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.427486  decreased coverage  0.00324581 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2438  hypothetical protein  38.94 
 
 
562 aa  313  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  40.78 
 
 
689 aa  170  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1379  hypothetical protein  31.51 
 
 
649 aa  130  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.254687  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  24.47 
 
 
1580 aa  68.6  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  32.84 
 
 
2434 aa  68.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  21.73 
 
 
2118 aa  65.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  24.64 
 
 
1278 aa  61.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  23.28 
 
 
2418 aa  60.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  24.88 
 
 
2000 aa  47.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  22.79 
 
 
1757 aa  46.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  23.27 
 
 
1984 aa  46.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>