160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1733 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1733  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  711    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1419  hypothetical protein  78.06 
 
 
357 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0746849 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0679  methanogenesis marker 13 metalloprotein  77.4 
 
 
352 aa  548  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.682238  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0520  hypothetical protein  72.8 
 
 
353 aa  527  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.268419  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0670  hypothetical protein  70.54 
 
 
354 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0106  hypothetical protein  57.58 
 
 
369 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0346  hypothetical protein  53.07 
 
 
370 aa  378  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.949651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1037  hypothetical protein  53.07 
 
 
370 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00782668  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1209  vanadium nitrogenase-associated related protein N  40.16 
 
 
366 aa  245  9e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1413  vanadium nitrogenase-associated related protein N  37.87 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1425  vanadium nitrogenase-associated related protein N  40.54 
 
 
366 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158785  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1313  vanadium nitrogenase-associated related protein N  37.9 
 
 
372 aa  235  8e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0483  vanadium nitrogenase-associated related protein N  39.62 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0604601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1943  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  35.71 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  28.89 
 
 
505 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  32.46 
 
 
487 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  27.64 
 
 
511 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  28.47 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  32.08 
 
 
512 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  35.23 
 
 
542 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.21 
 
 
546 aa  53.5  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0741  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.34 
 
 
546 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.07 
 
 
915 aa  52.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0235  oxidoreductase/nitrogenase component 1  36.28 
 
 
387 aa  52.8  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.317419  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  36.78 
 
 
448 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4051  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.28 
 
 
456 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.34 
 
 
544 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1350  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  31.43 
 
 
455 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452769  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1952  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.68 
 
 
544 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0543638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  31.4 
 
 
545 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  27.83 
 
 
516 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  30.25 
 
 
459 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  32.26 
 
 
425 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  29.23 
 
 
918 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2081  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  30.91 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  30.83 
 
 
347 aa  50.4  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  27.11 
 
 
462 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  27.64 
 
 
509 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  30.51 
 
 
462 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.96 
 
 
539 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  32.48 
 
 
466 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.09 
 
 
546 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02770  nitrogenase vanadium iron cofactor biosynthesis protein vnfE  35.92 
 
 
469 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.46 
 
 
918 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.41 
 
 
544 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  27.96 
 
 
467 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  31.25 
 
 
475 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.89 
 
 
546 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.91 
 
 
480 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.24 
 
 
519 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.25 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.07 
 
 
919 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.53 
 
 
510 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  24.26 
 
 
511 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.27 
 
 
542 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1076  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  31.78 
 
 
488 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.57688  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  29.66 
 
 
462 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  30.21 
 
 
475 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.78 
 
 
541 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.07 
 
 
539 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.42 
 
 
506 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0103  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.04 
 
 
480 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.21101  normal  0.23619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.08 
 
 
512 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  26.09 
 
 
515 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.12 
 
 
518 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01450  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.45 
 
 
475 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.27 
 
 
540 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5098  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  34.94 
 
 
487 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  27.78 
 
 
446 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.87 
 
 
905 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0972  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  31.78 
 
 
488 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  24.74 
 
 
519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.42 
 
 
551 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  29.29 
 
 
917 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4796  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.71 
 
 
462 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.933705  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  24.39 
 
 
509 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.42 
 
 
506 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4139  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.28 
 
 
936 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.42 
 
 
516 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  21.12 
 
 
519 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.12 
 
 
519 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.37 
 
 
518 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.08 
 
 
519 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.06 
 
 
512 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  26.97 
 
 
587 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.27 
 
 
512 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4460  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  29.91 
 
 
556 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.38 
 
 
487 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  29.66 
 
 
462 aa  46.2  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  32.58 
 
 
919 aa  46.2  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0663  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.1 
 
 
478 aa  46.2  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  30.97 
 
 
452 aa  46.2  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7729  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.2 
 
 
497 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  28.41 
 
 
511 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.11 
 
 
511 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  26.47 
 
 
919 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  19.35 
 
 
519 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  25.53 
 
 
519 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.32 
 
 
489 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  25.26 
 
 
458 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>