More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1785 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1506  carbonic anhydrase  97.94 
 
 
368 aa  661    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1785  carbonic anhydrase  100 
 
 
340 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0548346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1506  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  97.35 
 
 
340 aa  624  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0349628  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2259  carbonic anhydrase  72.49 
 
 
339 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.288291  normal  0.676633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0741  carbonic anhydrase  60.53 
 
 
343 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1749  carbonic anhydrase  55.39 
 
 
356 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0545  carbonic anhydrase  46.48 
 
 
340 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  hitchhiker  0.00175013 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3659  carbonic anhydrase  44.21 
 
 
347 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0725502  normal  0.181373 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5022  carbonic anhydrase  44.35 
 
 
348 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.585067  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0858  hexapaptide repeat-containing transferase  33.54 
 
 
172 aa  101  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1066  hexapeptide transferase family protein  34.18 
 
 
170 aa  101  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  34.36 
 
 
185 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_002978  WD0466  hexapeptide transferase family protein  30.82 
 
 
171 aa  100  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  36.08 
 
 
182 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  34.12 
 
 
185 aa  99  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  41.29 
 
 
176 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  36.88 
 
 
182 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  40.13 
 
 
182 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  31.29 
 
 
182 aa  96.7  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5080  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  34.9 
 
 
170 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  31.29 
 
 
182 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  31.29 
 
 
182 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  31.29 
 
 
182 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  31.9 
 
 
184 aa  96.3  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  36.94 
 
 
180 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  36.94 
 
 
180 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  36.94 
 
 
180 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  35.12 
 
 
180 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  32.54 
 
 
181 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  30.67 
 
 
182 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  31.29 
 
 
182 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  30.67 
 
 
182 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0011  acetyltransferase/carbonic anhydrase  33.33 
 
 
169 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  31.29 
 
 
171 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  30.67 
 
 
182 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  30.67 
 
 
182 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.84 
 
 
169 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  38.56 
 
 
179 aa  94  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  35.53 
 
 
179 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  38.56 
 
 
179 aa  93.6  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.76 
 
 
185 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3658  acetyltransferase/carbonic anhydrase  33.12 
 
 
175 aa  93.2  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  32.94 
 
 
182 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  34.1 
 
 
179 aa  92.8  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  29.3 
 
 
174 aa  92.8  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  37.09 
 
 
175 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  37.09 
 
 
175 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  32.79 
 
 
184 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  30.06 
 
 
184 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  35.2 
 
 
179 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0045  hexapeptide transferase family protein  33.12 
 
 
185 aa  91.7  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0961185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  35.71 
 
 
192 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  30.57 
 
 
176 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  32.54 
 
 
182 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  35.44 
 
 
184 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  35.44 
 
 
184 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2116  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  31.79 
 
 
224 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  35.44 
 
 
184 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  36.42 
 
 
175 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0072  transferase  31.71 
 
 
187 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  35.44 
 
 
184 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  35.44 
 
 
184 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  35.44 
 
 
177 aa  90.1  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  36.6 
 
 
178 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  32.91 
 
 
180 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  31.9 
 
 
183 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  35.58 
 
 
187 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  33.74 
 
 
184 aa  90.1  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  33.77 
 
 
180 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  33.78 
 
 
175 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  29.81 
 
 
170 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  35.44 
 
 
256 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  32.52 
 
 
184 aa  89.7  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  31.95 
 
 
178 aa  89.7  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  35.44 
 
 
256 aa  89.7  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  33.77 
 
 
180 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  33.96 
 
 
174 aa  89.4  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  38.46 
 
 
185 aa  89  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  29.19 
 
 
170 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4870  transferase family protein  29.01 
 
 
170 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  29.19 
 
 
170 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  29.19 
 
 
170 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  35.44 
 
 
293 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  34.08 
 
 
189 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  29.19 
 
 
170 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  28.57 
 
 
170 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  30.06 
 
 
177 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  34.48 
 
 
180 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  30.57 
 
 
173 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  32.57 
 
 
189 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.14 
 
 
180 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  30.57 
 
 
174 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  30.59 
 
 
184 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  35.48 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  28.57 
 
 
170 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  28.57 
 
 
170 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  32.69 
 
 
173 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1838  carbonic anhydrase  35.67 
 
 
162 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222248  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  28.57 
 
 
170 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  36.13 
 
 
176 aa  87  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>