More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3473 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  99.61 
 
 
256 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  98.83 
 
 
293 aa  523  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  99.46 
 
 
184 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  99.46 
 
 
184 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  98.37 
 
 
184 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  82.87 
 
 
184 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  74.16 
 
 
180 aa  278  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  74.44 
 
 
182 aa  277  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  73.33 
 
 
182 aa  275  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  71.35 
 
 
178 aa  271  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  73.03 
 
 
178 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  71.35 
 
 
180 aa  262  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  71.35 
 
 
180 aa  262  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  71.35 
 
 
180 aa  262  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  65.52 
 
 
177 aa  248  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  64.41 
 
 
184 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  63.07 
 
 
182 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  61.67 
 
 
185 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  60.89 
 
 
179 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  64.37 
 
 
179 aa  242  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  63.79 
 
 
183 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  63.01 
 
 
179 aa  241  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  61.36 
 
 
182 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  61.36 
 
 
182 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  63.43 
 
 
181 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  61.36 
 
 
182 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  62.64 
 
 
192 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  63.22 
 
 
182 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  63.48 
 
 
181 aa  238  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000367586  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
181 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  59.43 
 
 
181 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  60.23 
 
 
181 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  234  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  61.93 
 
 
182 aa  234  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  58.86 
 
 
180 aa  234  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  58.86 
 
 
180 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  60 
 
 
180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  60.11 
 
 
182 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  60.11 
 
 
182 aa  231  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  60.11 
 
 
182 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  59.2 
 
 
180 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  59.77 
 
 
184 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  60.11 
 
 
182 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  58.99 
 
 
182 aa  228  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  62.36 
 
 
180 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  58.05 
 
 
179 aa  225  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  59.09 
 
 
185 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  53.26 
 
 
185 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  56.82 
 
 
184 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  59.22 
 
 
179 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  56 
 
 
180 aa  209  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  53.98 
 
 
177 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  53.76 
 
 
180 aa  205  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  53.45 
 
 
176 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  49.71 
 
 
185 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  51.7 
 
 
178 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  51.16 
 
 
176 aa  198  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  52.05 
 
 
179 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3842  transferase  54.65 
 
 
176 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  55.23 
 
 
179 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  51.38 
 
 
189 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  50 
 
 
187 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  50 
 
 
187 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03943  transferase  51.74 
 
 
181 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  51.45 
 
 
169 aa  183  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  51.16 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  48.3 
 
 
174 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  47.43 
 
 
179 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  48.55 
 
 
175 aa  168  7e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  45.76 
 
 
175 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  45.76 
 
 
175 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  45.2 
 
 
175 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  41.95 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  45.2 
 
 
177 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  44.83 
 
 
177 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  44.83 
 
 
177 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  44.83 
 
 
177 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  41.57 
 
 
182 aa  158  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  43.18 
 
 
186 aa  158  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  41.01 
 
 
182 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  41.01 
 
 
182 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1936  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  43.65 
 
 
177 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  47.88 
 
 
175 aa  155  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  46.71 
 
 
175 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  49.68 
 
 
174 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  43.6 
 
 
170 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  42.37 
 
 
189 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0045  hexapeptide transferase family protein  42.16 
 
 
185 aa  149  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0961185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0290  acetyltransferase  42.69 
 
 
180 aa  148  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0175113 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  42.29 
 
 
177 aa  148  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2116  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  41.48 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.86 
 
 
180 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  46.2 
 
 
174 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>