17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1514 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  407  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  407  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  43.37 
 
 		 169 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  42.38 
 
 		 166 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  42.38 
 
 		 166 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  38.61 
 
 		 259 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  41.72 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  35.23 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  32.62 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  36.71 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  35.09 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  36.08 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  30.26 
 
 		 150 aa  48.5  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  28.21 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  28.67 
 
 		 153 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  24.36 
 
 		 162 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  30.68 
 
 		 168 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>