59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1119 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1119    100 
 
 		 741 bp  1469    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112614 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  88.99 
 
 		 840 bp  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  88.99 
 
 		 840 bp  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  88.99 
 
 		 840 bp  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  88.99 
 
 		 840 bp  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  88.99 
 
 		 840 bp  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0958  integrase catalytic region  85.14 
 
 		 792 bp  414  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4343    84.64 
 
 		 816 bp  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1901  integrase catalytic region  92.75 
 
 		 474 bp  272  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 783 bp  264  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 783 bp  264  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3901  cache type 2 domain-containing protein  90.18 
 
 		 1032 bp  196  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0232    86.36 
 
 		 320 bp  151  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2757    84.62 
 
 		 786 bp  60  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5483  putative integrase  91.11 
 
 		 468 bp  58  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.704423 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  85.51 
 
 		 798 bp  58  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  85.51 
 
 		 798 bp  58  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  91.11 
 
 		 792 bp  58  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  85.51 
 
 		 798 bp  58  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  85.51 
 
 		 798 bp  58  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  94.29 
 
 		 672 bp  54  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  87.27 
 
 		 1479 bp  54  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3471  hypothetical protein  87.27 
 
 		 1017 bp  54  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  87.27 
 
 		 1200 bp  54  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1494  hypothetical protein  86.44 
 
 		 693 bp  54  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03796    84.85 
 
 		 546 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  84.85 
 
 		 846 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04015    84.85 
 
 		 783 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04078    84.85 
 
 		 486 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.532563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  84.85 
 
 		 846 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  84.85 
 
 		 846 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  84.85 
 
 		 846 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04488  transposase  84.85 
 
 		 426 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 846 bp  52  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3102    81.63 
 
 		 438 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03666    84.85 
 
 		 816 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  84.85 
 
 		 546 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  84.85 
 
 		 648 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01537    84.85 
 
 		 807 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.502784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01541  transposase  84.85 
 
 		 345 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.728343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01848    84.85 
 
 		 786 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01935    84.85 
 
 		 345 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02161  transposase  84.85 
 
 		 546 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02481    84.85 
 
 		 546 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02530  ISXoo3 transposase ORF B  84.85 
 
 		 486 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02557    84.85 
 
 		 546 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.141347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02564  transposase  84.85 
 
 		 546 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02741    84.85 
 
 		 783 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03027    84.85 
 
 		 486 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03281    84.85 
 
 		 546 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357178  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  84.85 
 
 		 846 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03720  transposase  84.85 
 
 		 546 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0208    83.56 
 
 		 330 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  91.89 
 
 		 819 bp  50.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  91.89 
 
 		 819 bp  50.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  91.89 
 
 		 819 bp  50.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  91.89 
 
 		 819 bp  50.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  91.89 
 
 		 819 bp  50.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01377  transposase  86.54 
 
 		 318 bp  48.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>