17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0876 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0876  chorismate mutase  100 
 
 
95 aa  192  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707884  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3126  chorismate mutase  55.79 
 
 
95 aa  102  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0155  chorismate mutase  47.31 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1353  chorismate mutase  44.21 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.397236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1988  Chorismate mutase  43.82 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  34.88 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  37.18 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  35.29 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  38.46 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  36.47 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  32.94 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2349  Chorismate mutase  32.94 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0301924  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2509  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  31.71 
 
 
333 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0910  chorismate mutase  30.68 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.841588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2533  Chorismate mutase  27.27 
 
 
108 aa  40  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  30.49 
 
 
378 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>