17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0340 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  100 
 
 
312 aa  625  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1505  UbiA prenyltransferase  26.72 
 
 
289 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0383  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  29.03 
 
 
577 aa  59.3  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1569  UbiA prenyltransferase  23.36 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  26.34 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  23.12 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  20.26 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0980  UbiA prenyltransferase  24.55 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915074  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  21.31 
 
 
304 aa  55.8  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  20.77 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1111  UbiA prenyltransferase  23.21 
 
 
289 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0881749  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0368  hypothetical protein  24.31 
 
 
293 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2064  UbiA prenyltransferase  24.05 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  24.09 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  23.44 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  29.47 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  28.4 
 
 
283 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>