44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0044 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0044  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0274  hypothetical protein  42.62 
 
 
61 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  47.5 
 
 
574 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
368 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0165  hypothetical protein  45.65 
 
 
227 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
576 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.43 
 
 
749 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.67 
 
 
428 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0843  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.88 
 
 
206 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.463441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  43.75 
 
 
322 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1450  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 
762 aa  43.5  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1572  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.82 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3099  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.9 
 
 
369 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0141541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  42.22 
 
 
280 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  46.67 
 
 
306 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1641  aldo/keto reductase  42.5 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.316031  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.22 
 
 
296 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.18 
 
 
292 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.22 
 
 
305 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1210  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
315 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  37.74 
 
 
434 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  37.5 
 
 
379 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.08 
 
 
367 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2266  aldo/keto reductase  47.5 
 
 
317 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000706888 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  41.46 
 
 
455 aa  41.6  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0152  aldo/keto reductase  40 
 
 
315 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.145765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.17 
 
 
384 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.78 
 
 
331 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1718  aldo/keto reductase  35 
 
 
316 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2501  aldo/keto reductase  35 
 
 
316 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.99 
 
 
206 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
398 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1711  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  42 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1301  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.72 
 
 
375 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  37.78 
 
 
594 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1874  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.42 
 
 
362 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06210  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  38.1 
 
 
425 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0206  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.5 
 
 
301 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  40 
 
 
392 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0247  hypothetical protein  31.34 
 
 
307 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  35.42 
 
 
255 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  42.86 
 
 
314 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1379  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40 
 
 
207 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.860949  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0096  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.96 
 
 
383 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.337966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>