22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0152 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  165  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  51.39 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  44.44 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  41.67 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1098  hypothetical protein  72.97 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.459799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  39.39 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  37.31 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  35.82 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0701  YcfA family protein  38.71 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00509047  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  37.31 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  32.5 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0355  hypothetical protein  31.58 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  35.62 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  35.62 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1137  YcfA family protein  36.84 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0318024  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  32.81 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  34.85 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  35.14 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  32.81 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  36.36 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  37.14 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0161  YcfA family protein  46.55 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>