More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0143 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  46.46 
 
 
776 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  46.2 
 
 
776 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  69.76 
 
 
802 aa  1125    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  46.51 
 
 
773 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  47.63 
 
 
840 aa  652    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  76.04 
 
 
794 aa  1235    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  47.73 
 
 
812 aa  663    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  64.29 
 
 
797 aa  996    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  70.4 
 
 
793 aa  1104    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  48.31 
 
 
797 aa  638    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  100 
 
 
794 aa  1593    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  46.46 
 
 
776 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  46.46 
 
 
776 aa  639    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  48.67 
 
 
797 aa  636    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  46.2 
 
 
776 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  46.07 
 
 
776 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  47.45 
 
 
774 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  53.5 
 
 
768 aa  633  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  46.2 
 
 
776 aa  635  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  46.25 
 
 
773 aa  631  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  46.25 
 
 
773 aa  632  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.47 
 
 
816 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  47.59 
 
 
775 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  46.02 
 
 
828 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  44.22 
 
 
817 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  46.42 
 
 
810 aa  622  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  44.9 
 
 
792 aa  619  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  51.92 
 
 
778 aa  617  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  46.15 
 
 
835 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  47.28 
 
 
815 aa  617  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  44.37 
 
 
811 aa  616  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  45.89 
 
 
843 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  47.31 
 
 
773 aa  617  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  46.02 
 
 
835 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  44.64 
 
 
798 aa  615  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  47.29 
 
 
804 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  44.93 
 
 
837 aa  612  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  44.59 
 
 
785 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  44.9 
 
 
808 aa  608  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 
819 aa  612  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  44.2 
 
 
785 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  43.21 
 
 
775 aa  609  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  46.94 
 
 
783 aa  609  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  44.97 
 
 
802 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  44.46 
 
 
785 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  44.46 
 
 
785 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  44.46 
 
 
785 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  46.12 
 
 
812 aa  608  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  41.82 
 
 
846 aa  611  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  46.31 
 
 
810 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  43.53 
 
 
801 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  44.2 
 
 
785 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  44.2 
 
 
785 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  43.52 
 
 
810 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  46.26 
 
 
803 aa  606  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  43.9 
 
 
806 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  43.91 
 
 
823 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  44.07 
 
 
785 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  52.1 
 
 
797 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  43.72 
 
 
804 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  53.41 
 
 
788 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  43.72 
 
 
804 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  45.97 
 
 
806 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  46.93 
 
 
801 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  43.98 
 
 
781 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  45.43 
 
 
867 aa  604  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  44.2 
 
 
785 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  43.73 
 
 
785 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44.33 
 
 
785 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 
785 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  43.46 
 
 
806 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  42.52 
 
 
805 aa  600  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  43.83 
 
 
805 aa  600  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  43.94 
 
 
784 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  44.33 
 
 
802 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  46.03 
 
 
774 aa  598  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  43.11 
 
 
817 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.76 
 
 
786 aa  599  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  42.33 
 
 
815 aa  599  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  45.19 
 
 
817 aa  601  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  44.14 
 
 
816 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  44.3 
 
 
783 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  50.57 
 
 
802 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  50.08 
 
 
823 aa  598  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  45.25 
 
 
809 aa  598  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.34 
 
 
787 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  42.42 
 
 
792 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  43.6 
 
 
783 aa  597  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  42.84 
 
 
833 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  43.67 
 
 
814 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 
788 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  44.75 
 
 
806 aa  597  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  49.75 
 
 
786 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  46.38 
 
 
810 aa  597  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  46.76 
 
 
804 aa  597  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.53 
 
 
793 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  45.76 
 
 
794 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  49.68 
 
 
805 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  47 
 
 
824 aa  595  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  43.21 
 
 
811 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>