28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2383 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  810    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  33.53 
 
 		 430 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  30.15 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0195  hypothetical protein  29.06 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000146938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  27.95 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  36.7 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  26.43 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  26.06 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  35.19 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  26.04 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  24.32 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  30.49 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  27.56 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  27.88 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  29.24 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  25.61 
 
 		 463 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0061  hypothetical protein  27.95 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0757  hypothetical protein  26.99 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.503985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  24.85 
 
 		 459 aa  86.3  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  24.06 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  31.51 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  22.84 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  22.73 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1517  hypothetical protein  22.5 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0894  hypothetical protein  21.76 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  29.27 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  22.06 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2171  hypothetical protein  28.43 
 
 		 476 aa  42.7  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.519692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>