23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2168 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  39.13 
 
 
236 aa  161  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  32.22 
 
 
200 aa  98.6  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  30.3 
 
 
180 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  29.21 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  29.38 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  27.8 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  30.94 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  32.43 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  30.34 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3209  protein of unknown function UPF0153  28.26 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.348826  normal  0.121177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0557  protein of unknown function UPF0153  30.67 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  23.08 
 
 
229 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  23.86 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  26.67 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  38.46 
 
 
142 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  46.43 
 
 
166 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  27.11 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  25 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  24.39 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  22 
 
 
237 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1546  hypothetical protein  31.82 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.231581  hitchhiker  0.0000778031 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  26.56 
 
 
141 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>