22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1038 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1038  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
83 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2124  glutaredoxin-like protein  62.65 
 
 
83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2810  glutaredoxin-like protein  53.09 
 
 
84 aa  97.1  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0010  glutaredoxin  51.95 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0851893 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0707  glutaredoxin  54.05 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1708  glutaredoxin  45 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252246  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0321  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 
53 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  33.33 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  34.92 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  34.92 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  35.38 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  25 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  32.35 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  41.46 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  37.1 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  25 
 
 
78 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  39.34 
 
 
83 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1167  glutaredoxin  29.41 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.957373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  45.24 
 
 
194 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1145  glutaredoxin  29.41 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  29.03 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.94 
 
 
81 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>