21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2124 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2124  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
83 aa  167  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1038  glutaredoxin-like protein  62.65 
 
 
83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2810  glutaredoxin-like protein  54.93 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0707  glutaredoxin  58.21 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1708  glutaredoxin  46.25 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252246  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0010  glutaredoxin  54.17 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0851893 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0321  glutaredoxin-like protein  57.89 
 
 
53 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  40.98 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  36.21 
 
 
260 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  30.16 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  35 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  41.82 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  42.86 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  31.75 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  31.75 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  39.62 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  37.5 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  28.57 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  40.91 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  35.94 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  36.07 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>