23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0167 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  85.16 
 
 		 132 aa  223  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  77.61 
 
 		 134 aa  221  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  76.12 
 
 		 134 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  81.45 
 
 		 139 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  74.63 
 
 		 144 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  77.34 
 
 		 139 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  79.03 
 
 		 139 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  79.84 
 
 		 139 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  74.6 
 
 		 184 aa  206  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  70.68 
 
 		 135 aa  201  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  73.02 
 
 		 134 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  68.5 
 
 		 132 aa  194  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  68.5 
 
 		 135 aa  190  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  80.47 
 
 		 133 aa  187  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  74.22 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  43.75 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  55 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  45.76 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  42.62 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  45 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  51.43 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  35.71 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>