More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2870 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  100 
 
 
468 aa  958    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  59.96 
 
 
460 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  58.26 
 
 
471 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.59 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  49.67 
 
 
456 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.88 
 
 
458 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.43 
 
 
452 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  51.55 
 
 
458 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.55 
 
 
458 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  51.55 
 
 
458 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  51.66 
 
 
458 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  49.04 
 
 
497 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.24 
 
 
476 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.16 
 
 
467 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.46 
 
 
455 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.67 
 
 
470 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  48.88 
 
 
453 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.38 
 
 
467 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51 
 
 
456 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.11 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.24 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.24 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.02 
 
 
470 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  47.06 
 
 
467 aa  415  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  49.34 
 
 
469 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.48 
 
 
446 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.72 
 
 
467 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.92 
 
 
447 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  48.8 
 
 
471 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.57 
 
 
447 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.03 
 
 
466 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  48.28 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.04 
 
 
446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  48.06 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.19 
 
 
467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  48.28 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  48.28 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  48.28 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.39 
 
 
447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  48.02 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  50.55 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.84 
 
 
453 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.84 
 
 
453 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  46.97 
 
 
430 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.63 
 
 
461 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  48.06 
 
 
453 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  46.97 
 
 
430 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  48.68 
 
 
445 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  49.45 
 
 
447 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.07 
 
 
474 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  48.8 
 
 
447 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  46.41 
 
 
454 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  46.41 
 
 
454 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  46.62 
 
 
454 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  46.41 
 
 
454 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  46.19 
 
 
454 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.89 
 
 
466 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0453  para-aminobenzoate synthase, component I  46.09 
 
 
452 aa  394  1e-108  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0249447  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.58 
 
 
477 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  48.59 
 
 
448 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  54.74 
 
 
408 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.02 
 
 
473 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.51 
 
 
490 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  48.25 
 
 
450 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  49.01 
 
 
443 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  47.53 
 
 
462 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.53 
 
 
480 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  44.51 
 
 
509 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  43.81 
 
 
476 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.23 
 
 
474 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.38 
 
 
466 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.71 
 
 
444 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  41.75 
 
 
495 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.53 
 
 
480 aa  352  7e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.56 
 
 
457 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.1 
 
 
466 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.16 
 
 
474 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  40.6 
 
 
448 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.11 
 
 
449 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  39.22 
 
 
448 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.38 
 
 
464 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.29 
 
 
466 aa  326  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.07 
 
 
472 aa  325  9e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.66 
 
 
469 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.92 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.8 
 
 
460 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.07 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.92 
 
 
472 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.18 
 
 
721 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.96 
 
 
480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  42.33 
 
 
496 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  40.94 
 
 
491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  38.64 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.52 
 
 
482 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  40.58 
 
 
491 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1469  hypothetical protein  40.33 
 
 
440 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3709  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.79 
 
 
488 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131027  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41 
 
 
509 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1514  hypothetical protein  39.42 
 
 
440 aa  296  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.07 
 
 
434 aa  295  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>