20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1842 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1842  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1324    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4236  von Willebrand factor, type A  49.24 
 
 		 651 aa  607  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.644313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52050  ppkA-related protein  49.77 
 
 		 656 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2874  ppkA-related protein  49.07 
 
 		 653 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0665183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2629  von Willebrand factor, type A  47.9 
 
 		 663 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0467  von Willebrand factor type A  48.16 
 
 		 659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  40.44 
 
 		 665 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  40.97 
 
 		 632 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  38.12 
 
 		 1018 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  39.07 
 
 		 1032 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  38.6 
 
 		 1032 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1316  PpkA-related protein  33.53 
 
 		 671 aa  347  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3873  PpkA-related protein  35.2 
 
 		 631 aa  343  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3135  ppkA-related protein  34.74 
 
 		 631 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3417  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.96 
 
 		 629 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.996325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4055  hypothetical protein  33.54 
 
 		 634 aa  329  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0161077  normal  0.249127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0900  hypothetical protein  33.59 
 
 		 640 aa  324  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  30.96 
 
 		 702 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  28 
 
 		 349 aa  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1000  hypothetical protein  27.21 
 
 		 695 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>