47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03982 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  753    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  33.05 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  32.95 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  31.93 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  32.11 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  34.67 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  32.43 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  30.97 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  32.11 
 
 		 361 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  30.34 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  32.93 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  31.25 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  29.41 
 
 		 413 aa  192  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  30.67 
 
 		 357 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  30.95 
 
 		 357 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  30.95 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  30.77 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  30.6 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  28.28 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  24.65 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  24.58 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  24.58 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  33.13 
 
 		 541 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  32.53 
 
 		 541 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  23.45 
 
 		 385 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  20.89 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  29.1 
 
 		 595 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  25.53 
 
 		 996 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1124 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1831  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1013 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.85531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1009 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2757  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1024 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0520624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1874  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1011 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.794272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1098 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  24.38 
 
 		 1079 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  20.29 
 
 		 960 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  19.47 
 
 		 981 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  21.71 
 
 		 950 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  19.9 
 
 		 978 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  24 
 
 		 1069 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  19.41 
 
 		 978 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  19.42 
 
 		 978 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3872  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1188 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2486  hypothetical protein  24 
 
 		 1067 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0828259  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  19.42 
 
 		 978 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1158 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  24 
 
 		 1072 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>