34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01190 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  37.79 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  29.18 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  37.18 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  36.94 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  34.62 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  35.9 
 
 		 212 aa  98.6  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  27.35 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  34.51 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  34.51 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  33.8 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1300  hypothetical protein  35.25 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  33.1 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  32.39 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  32.39 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  32.39 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  33.57 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  33.12 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  37.39 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  30.28 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  39.13 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  31.25 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  34.48 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  24.48 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  27.07 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  25.42 
 
 		 188 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  31.13 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  30.84 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  26.36 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  27.91 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  30.28 
 
 		 313 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  23.68 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  26.39 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>