33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3235 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3235    100 
 
 		 261 bp  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257318  normal  0.453735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  87.88 
 
 		 801 bp  101  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  86.87 
 
 		 1200 bp  93.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  86.87 
 
 		 1200 bp  93.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  86.73 
 
 		 1200 bp  91.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  86.73 
 
 		 1200 bp  91.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  83.87 
 
 		 1014 bp  87.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    85.19 
 
 		 1184 bp  87.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  85.86 
 
 		 1200 bp  85.7  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2516  transposase mutator type  84.85 
 
 		 444 bp  77.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  81.82 
 
 		 1200 bp  71.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  81.82 
 
 		 1200 bp  71.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  81.02 
 
 		 1200 bp  65.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  81.02 
 
 		 1200 bp  65.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1925    89.47 
 
 		 596 bp  65.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    81.06 
 
 		 1039 bp  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    90.91 
 
 		 715 bp  56  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  85.71 
 
 		 1200 bp  54  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  96.3 
 
 		 1248 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  93.55 
 
 		 1197 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    93.55 
 
 		 2780 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  93.55 
 
 		 1197 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  93.55 
 
 		 1197 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  93.55 
 
 		 1197 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    93.55 
 
 		 2433 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  93.55 
 
 		 1197 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  96.3 
 
 		 1311 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1438    86.27 
 
 		 457 bp  46.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    91.43 
 
 		 2705 bp  46.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  96.3 
 
 		 1248 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  96.3 
 
 		 1248 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  96.3 
 
 		 1248 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12681  hypothetical protein  96.3 
 
 		 804 bp  46.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.001544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>