157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2485 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  100 
 
 
88 aa  174  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  87.64 
 
 
90 aa  153  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  62.2 
 
 
91 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  68.12 
 
 
95 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  68.12 
 
 
95 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  65.82 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  55.68 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
78 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  46.59 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  52.87 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  49.4 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  52.27 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  47.78 
 
 
79 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  50.56 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  50.77 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  61.7 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0882  twin arginine translocase protein A  58.82 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0873  twin arginine translocase protein A  58.82 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  64.91 
 
 
85 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1773  twin-arginine translocation protein TatA/E  55.71 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  72.92 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1487  twin arginine translocase protein A  74 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1685  twin arginine translocase protein A  72 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  56.72 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1164  twin arginine translocase protein A  69.23 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.16996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  57.38 
 
 
76 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1806  twin arginine translocase protein A  64.15 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0839673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  72.34 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  44.74 
 
 
74 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  36.9 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  42.25 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  40.85 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  40.85 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  40.85 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  37.18 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  37.18 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  48 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  37.18 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  37.18 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  37.18 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.51 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  35.53 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.06 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  39.44 
 
 
76 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  39.44 
 
 
76 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  39.44 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  42.65 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  36.99 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  38.24 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  42.42 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  37.35 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  70.97 
 
 
76 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.55 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  36.9 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  36.9 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0015  twin arginine-targeting protein translocase  61.22 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  48.08 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  34.57 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.57 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  32.93 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.37 
 
 
79 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  35.37 
 
 
79 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  35.37 
 
 
79 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  34.57 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  32.58 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  35.37 
 
 
79 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  33.77 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  34.15 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 
81 aa  53.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1416  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60.42 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  41.94 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  46.3 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  46.94 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  43.4 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  40.32 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  38.81 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  35.14 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  54.35 
 
 
71 aa  52  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  30.49 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 
85 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  37.68 
 
 
83 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  33.77 
 
 
82 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2956  twin arginine translocase protein A  31.4 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>